Аналіз концентрації вірусної РНК в осаді стічних вод дозволяє за кілька днів передбачити спалах COVID-19 і підготуватися до неї. До такого висновку прийшла команда дослідників, вивчивши дані з американського міста Нью-Хейвен. Препринт їх статті був опублікований на сайті medRxiv.org. Автори вважають, що такий підхід набагато оперативніший, ніж відстеження пандемії за допомогою тестування.
Оновлено: у вересні 2020 року стаття опублікована в.
Намагаючись відстежити поширення коронавірусу SARS-CoV-2, влада орієнтується на результати діагностичних тестів. Однак такий підхід недостатньо оперативний. Справа в тому, що тестування зазвичай піддають людей, у яких вже проявилися симптоми хвороби, а це відбувається приблизно через п'ять днів після зараження. Весь цей час пацієнт поширює інфекцію серед оточуючих. Іншими словами, існуючі методики відстають від пандемії на кілька днів і не охоплюють все населення. Ми детально висвітлювали цю проблему в блозі «Просто цифри».
Команда дослідників на чолі з Джорданом Печчіа (Jordan Peccia) з Єльського університету запропонувала новий підхід, який дозволить в реальному часі оцінювати розвиток ситуації з COVID-19. Вчені звернули увагу, що в стільці заражених SARS-CoV-2 міститься вірусна РНК. Її також виявляли в стічних водах. Це навело вчених на думку, що за допомогою аналізу неочищених вод з каналізації можна передбачати спалахи інфекції на рівні окремих муніципалітетів.
Автори проаналізували концентрацію коронавірусної РНК в осаді стічних вод, вироблених у місті Нью-Хейвен, штат Коннектикут, з 19 березня по 1 травня 2020 року. Для цього вони щодня брали проби шламу з очисних споруд, які обслуговують близько 200000 осіб. Ці дані порівняли з інформацією про кількість госпіталізацій і кількість нових пацієнтів з діагнозом COVID-19, яку надали місцеві служби охорони здоров'я.
Графік, що відображає зростання вмісту коронавірусної РНК в осаді стічних вод, виявився майже точною копією графіків, на яких відзначалася динаміка числа госпіталізацій і діагностованих випадків зараження SARS-CoV-2. При цьому максимальна концентрація РНК у шламі була відзначена за три дні до піку госпіталізацій і за сім днів до піку виявлених випадків. Це означає, що аналіз осаду стічних вод дійсно може допомогти заздалегідь передбачити спалах COVID-19 і вжити відповідних заходів.
Хоча частинки РНК SARS-CoV-2 часто виявлялися в стільці пацієнтів, довгий час було неясно, чи здатний цей вірус вражати клітини кишечника. Підтвердження цьому знайшли дослідники з Китаю. Вони успішно інфікували коронавірусом штучні кишечники людини і кажана.