Вчені розробили тест-систему рідкої біопсії, яка виявила гепатоцелюлярну карциному у 17 відсотків пацієнтів, які до цього вже скористалися стандартними методами скринінгу раку печінки. Метод використовувався для когорти групи ризику - носіїв вірусу гепатиту В (HBV). Стаття опублікована в журналі.
У 2018 році рак печінки виявили у 841080 осіб, це третя за значимістю причина онкологічної смертності. Гістологічно 85-90 відсотків випадків раку печінки - гепатоцелюлярна карцинома (ГЦК). Регулярний скриниг на цю патологію рекомендується пацієнтам з цирозом печінки і носіям поверхневого антигену вірусу гепатиту В або австралійського антигену (HBsAg), який є маркером поточної інфекції. Зараз він включає ультразвукове дослідження і визначення альфа-фетопротеїну (АФП) у сироватці крові. Ця методика суттєво покращила загальну виживаність, завдяки виявленню ГЦК на ранніх стадіях, коли можливе радикальне лікування.
Рідка біопсія, заснована на виявленні мутацій у вільно циркулюючих ДНК (сцДНК), вже показала свій діагностичний потенціал у попередніх наукових роботах (Bettegowda C, et al., Chaudhuri AA, et al.). Також було встановлено, що її доповнення визначенням інших біомаркерів може збільшити точність методу. Попередні дослідження включали пацієнтів з вже діагностованої ГЦК і здорових пацієнтів, що може знижувати точність методу у людей з підвищеним ризиком хвороби, оскільки передракові стани, включаючи цироз печінки, можуть впливати на характер виявлених мутацій.
Чунфенг Ку (Chunfeng ^) з китайського Національного ракового центру і його колеги розробили і випробували нову тест-систему рідкої біопсії HCCscreen для виявлення гепатоцелюлярної карциноми у пацієнтів з підвищеним ризиком. Тест-система визначає два типи біомаркерів: поширені при раку печінки генетичні пошкодження, які можна виявити в сцДНК, а також білки АФП і дез-гамма-карбоксі-протромбін (ДМКП). Відомо, що з вірусом гепатиту В пов'язані мутації хоча б в одному з наступних генів: TP53, CTNNB1, AXIN1і промотора TERT (зворотний транскриптази теломерази). Також вчені розглянули в якості можливого біомаркера розриви ДНК гепатоцитів в результаті інтеграції генома вірусу. Інтеграція HBV в кожну клітку індивідуальна, тому виявлення в крові декількох копій сцДНК з однаковим сайтом інтеграції може говорити про клональне розмноження цієї клітини при раковому зростанні.
Учасників для наукової роботи відбирали за результатами скринінгу 72720 осіб, проведеного в чотирьох медичних центрах. У дослідженні запросили брати участь 3793 людини, у яких в крові був виявлений HBsAg. У 176 з них були насторожувальні показники скринінгу АФП/УЗД, інші склали АФП/УЗД-негативну групу.
Спочатку автори випробували тест-систему на пробній когорті АФП/УЗД-позитивних пацієнтів. У неї включили 70 осіб, у яких діагноз ГЦК був підтверджений, і 65 осіб, у яких цей діагноз був виключений за допомогою динамічних комп'ютерної томографії (КТ) або магнітно-резонансної томографії (МРТ), а також гістологічно. Щоб оцінити значущість різних генетичних біомаркерів, автори звели всі цікаві їх мутації цДНК в одну шкалу оцінки (ROI-score). Для створення діагностичної системи вони також використовували варіанти інтеграції HBV в геном, два білкових маркери (АФП і ДМКП), два клінічних (стать і вік) і один експериментальний показник (концентрація цДНК). У пробній когорті методика продемонструвала чутливість 85 відсотків і специфічність 93 відсотки (площа під кривою 0,928). Діагностичну цінність підтвердили як генетичні, так і білкові маркери.
Далі вчені перевірили, чи може HCCscreen виявляти ГЦК у носіїв HBsAg з АФП/УЗД-негативної групи, у яких не було симптомів хвороби. Новий метод продемонстрував позитивний результат у 24 осіб з 331. Протягом восьми наступних місяців 17 з цих пацієнтів зазнали динамічної КТ, чотири пройшли скринінг АФП/УЗД, з трьома проводилися телефонні інтерв'ю. Діагноз ГЦК підтвердився у чотирьох пацієнтів, при візуалізації у них виявилися пухлини діаметром до трьох сантиметрів. За той же період нікому з 307 пацієнтів з негативним результатом діагноз ГЦК поставлений не був. Таким чином, позитивна прогностична цінність системи HCCscreen для АФП/УЗД-негативних пацієнтів з групи ризику склала 17 відсотків, чутливість - 100 відсотків (чотири з чотирьох), специфічність - 94 відсотки (307 з 327).
Автори зазначають, що чутливість HCCscreen вища за чутливість тесту на АФП. Вони вказують, що в 85 відсотках випадків розмір пухлин, виявлених HCCscreen, був менше п'яти сантиметрів, і в 68 відсотках менше трьох сантиметрів в діаметрі, що відповідає раннім стадіям, на яких можливе лікування хвороби. На думку вчених, новий метод перспективний для ранньої діагностики. Також вони підкреслюють, що поточна версія тесту не має такої ж високої чутливості для людей без факторів ризику розвитку раку печінки, але існує можливість її вдосконалення.
У діагностиці онгологічних захворювань є й інші передові розробки. Так, американська компанія Illumin, найбільший світовий розробник і виробник устаткування для секвенування ДНК, планувала створення універсального тесту для раннього виявлення раку. Першими на ринок повинні вийти скринінгові тести на пухлини легенів і грудей.