Спалах лихоманки Ебола в Гвінеї на початку 2021 року викликав вірус, що пересидів п'ять років в організмі людини, уклали генетики, відсеквенувавши 12 свіжих гвінейських зразків еболавірусу. Це свого роду рекорд - досі вірус у перехворілих людей виявляли тільки через рік або два після одужання. Однак хто саме спровокував новий спалах і як вірус потрапив в організм першої пацієнтки, все ще невідомо. Результати дослідження опубліковані в журналі.
Лихоманка Ебола з'являється в різних країнах Африки починаючи з 1970-х років і приблизно раз на кілька років. Найбільший зі спалахів розгорнувся у Гвінеї, Ліберії та Сьєрра-Леоне у 2014-2016 роках, тоді загинули понад дві з половиною тисячі осіб. На початку 2021 року в Гвінеї зафіксували новий спалах. Вона виявилася коротшою: з лютого по квітень влада країни виявила 16 підтверджених випадків захворювання (з них 12 осіб померли), а вже влітку оголосила про закінчення спалаху.
Проте досі залишається невідомим, звідки ці 16 осіб отримали еболавірус. Вважається, що в попередній раз перший заразився, маленький сільський хлопчик, підхопив інфекцію безпосередньо від кажанів, які жили в дуплі дерева, де він любив грати (цю історію, а також історії інших «нульових пацієнтів», ми розповідали в тексті «Дари любові»). Але цього разу, хоча відомо, від кого заразилися більшість хворих - це 51-річна медсестра з гвінейського міста Гуеке - встановити походження її вірусу відразу не вдалося.
Тоді група африканських і європейських вчених відсеквенувала геноми двох еболавірусів зі свіжих зразків, узятих у хворих людей. Вони виявили, що в цих геномах підозріло мало відмінностей від геномів 2016 року - ніби весь цей час вірус не еволюціонував в організмі кажана-носія, а перебував у підступному стані і не розмножувався. Дослідники припустили, що вірус міг пережити ці п'ять років в тілі когось з перехворілих в ході попереднього спалаху. Принаймні, відомі випадки, коли люди залишалися заразними протягом року або навіть двох після хвороби.
Свої попередні спостереження вчені опублікували на нерецензованому порталі virological.org. Після цього до них приєдналися дослідники з інших країн, і зараз остаточні дані від Альфи Кейта (Alpha Keita) і співавторів з'явилися в журналі. Автори роботи зібрали вже 19 геномів еболавірусу від 12 пацієнтів і відсеквенували їх у трьох незалежних лабораторіях, щоб побудувати більш точне філогенетичне дерево.
Дослідники підтвердили, що всі 12 еболавірусів від нових пацієнтів найближче до геномів 2016 року і споріднені один одному, а значить, у спалаху було єдине джерело. При цьому найближчий загальний предок усіх цих геномів, за оцінками вчених, існував приблизно 22 січня - за кілька днів до появи симптомів у медсестри з Гуеке. Це означає, що, швидше за все, вона дійсно була першим пацієнтом у цьому спалаху, і ніякого іншого ланцюжка заражень не було.
Крім того, дослідники підрахували, що за 5 років вірус накопичив всього 12 змін у геномі. Але якби він провів ці роки в організмі кажана - судячи з того, що ми зараз знаємо про швидкість еволюції еболавірусу - в його генах повинно було з'явитися 95 замін. Автори роботи вважають, що навряд чи вірус міг з якихось причин еволюціонувати повільніше. Швидше, на їхню думку, він провів ці роки в латентному стані в організмі людини. Принаймні, в 2016 році вже був описаний геном вірусу, який за 500 днів в тілі пацієнта накопичив в 5,5 разів менше замін, ніж можна було очікувати.
А ось як саме могла заразитися медсестра з Гуеке, з'ясувати поки не вийшло. Дослідники припустили, що вона сама могла бути носієм латентного еболавірусу. Але це виглядає не дуже правдоподібним - в попередній спалах ніяких симптомів у неї не було, а зі своїми далекими родичами, серед яких знайшлося кілька перехворілих лихоманкою, вона не спілкувалася.
Або ж медсестра могла заразитися від когось поза сім'єю. Відомо, що еболавірус може зберігатися в найрізноманітніших фізіологічних рідинах - не тільки в крові, але ще в насіннєвій рідині, вологоліщній сітці і навіть у грудному молоці. Однак серед пацієнтів, з якими вона контактувала перед появою симптомів, ні в кого лихоманки не виявили. Правда, іноді вона працювала неофіційно, поза лікарнею - але про це ніяких записів не збереглося, тому, можливо, знайти ту людину, яка носила в собі вірус протягом п'яти років між спалахами, вже не вийде. Зате африканським лікарям і вченим тепер належить бути ще уважніше по відношенню до людей, які перехворіли Еболою - хтось з них може виявитися джерелом нового спалаху.
Раніше ми розповідали про те, що лихоманка Ебола небезпечна навіть після одужання - перехворілі їй люди вмирають частіше за інших. Тим часом, в Європі вже схвалена перша вакцина від Еболи, а в США - перші ліки.