Вчені описали мікробіом крові

Американські, нідерландські та фінські вчені виявили, що в крові здорових людей і пацієнтів з різними захворюваннями присутній мікробіом. Також з'ясувалося, що при шизофренії мікробний склад крові відрізняється високою різноманітністю. Препринт дослідження опублікований на сервісі bceRxiv.


Співробітники Каліфорнійських університетів у Лос-Анджелесі, Девісі і Сан-Франциско з колегами з інших наукових центрів зібрали кров у 192 осіб. До вибірки увійшли 49 здорових осіб, а також по 48 пацієнтів з шизофренією і біполярним розладом і 47 осіб з бічним аміотрофічним склерозом.


У всіх зразках цільної крові виконали повне секвенування РНК. З отриманих даних виключили прочитання, характерні для людського геному і транскриптома, а також низькоякісні або занадто прості зчитування. Якісні дані, що, ймовірно, належать представникам кров'яної мікробіоти, використовували для філогенетичного і таксономічного аналізу з використанням маркерних генів.

У середньому по 1235 прочитань (1,24 відсотка) з кожного зразка вдалося віднести до сімействів генів бактерій або архей. Всього в дослідженій крові виявили 1880 мікробних таксонів, що відносяться до 23 біологічних типів (в середньому 4,1 порожніх 2 типу у кожної людини). Більшість з них належала до бактерій, решта - до архівів. Ознак присутності еукаріот і вірусів у зразках не було. Щоб виключити ймовірність мікробного забруднення зразків, протокол аналізу протестували на зразках стерильних і заражених різними патогенами клітинних ліній.

У всіх обстежених були виявлені бактерії типу, які домінували в більшості зразків. Також поширеними виявилися типи і - вони зустрічалися не менш ніж у чверті зразків з кожної групи.

Виявлений мікробний склад порівняли з мікробіомами інших органів (кишечника, ротової порожнини, дихальних шляхів і шкіри), використавши 499 метагеномних зразків, отриманих в рамках Human Microbiome Project. Вченим вдалося виявити збіг за 15 типами мікроорганізмів, які свідчать, що домінуючі таксони мікробіома крові найбільш тісно пов'язані з мікробіотою рота і кишечника.

Після введення поправки на стать, вік і технічні фактори з'ясувалося, що істотних відмінностей між кров'яними мікробіомами здорових людей, пацієнтів з біполярним розладом і бічним аміотрофічним склерозом немає, а при шизофренії він має набагато більш різноманітний склад. Різноманітність була неспецифічною, тобто не пов'язаною з переважанням певного мікробного профілю. Ці дані вдалося відтворити в додатковому дослідженні, але їх клінічне значення залишається неясним.

COM_SPPAGEBUILDER_NO_ITEMS_FOUND