Міжнародна група вчених показала, що геном шимпанзе містить стародавню примісь генів бонобо. Стаття опублікована в журналі.
Відомо, що два види роду - звичайний шимпанзе () і бонобо, або карликовий шимпанзе () - можуть схрещуватися в неволі. Однак досі неясно, чи відбувається гібридизація між цими видами в природі. Щоб зрозуміти це, а також прояснити еволюційну історію шимпанзе і бонобо, автори проаналізували 75 повних геномів обох видів. Зразки, з яких була виділена ДНК, були зібрані в 10 африканських країнах і покривали весь ареал роду. Така схема збору зразків дозволила ідентифікувати на 32 відсотки більше варіабельних сайтів (ділянок ДНК, що розрізняються в даній вибірці), ніж у попередніх дослідженнях.
Загальна оцінка генетичної структури проаналізованих популяцій показала, що серед сучасних шимпанзе найбільше генетичне розмаїття зберігається у центральних шимпанзе (підвид), в той час як інші три підвиди шимпанзе мають знижене генетичне розмаїття, що вказує на те, що їх популяції в рошлом пройшли через пляшкове горлечко. Автори також показали, що аналіз популяційної структури дозволяє за генетичною інформацією зразка визначити його географічне походження з точністю до країни і регіону всередині країни. Це дуже цінний висновок, тому що він дозволить визначати, де були спіймані тварини, конфісковані у браконьєрів - а це, в свою чергу, допоможе вистежити браконьєрів.
Порівняння геномів шимпанзе і бонобо показало, що в минулому - від 200 до 550 тисяч років тому - існував потік генів, спрямований від бонобо до предків центральних () і східних () шимпанзе. Пізніше, вже в результаті контакту між підвидами шимпанзе, гени бонобо потрапили також до західних шимпанзе () і шимпанзе з Нігерії і Камеруну (). Потім (100-200 тисяч років тому) відбулося ще одне перенесення генів від бонобо з центральним шимпанзе. При цьому близько 180 тисяч років тому, в проміжку між двома цими контактами, відбувся поділ центрального і східного підвидів. Нарешті, в якийсь момент (300-350 тисяч років тому) існував і потік генів у зворотному напрямку: від шимпанзе до бонобо (тобто мігрантами, які принесли свою ДНК в чужу популяцію, були в цьому випадку шимпанзе).
Автори зазначають, що наявні дані не дозволяють оцінити інтенсивність і тривалість гібридизації: неясно, чи відбувалася вона на низькому рівні протягом довгого часу або обмежувалася дискретними фазами інтенсивного обміну генів. Однак ясно, що між двома видами вже після їх розбіжності відбулося принаймні два вторинних контакти з обміном генами.
Вчені також ідентифікували в геномах шимпанзе передбачувані інтрогресовані регіони - тобто ті, що дісталися їм від бонобо. У геномах центральних шимпанзе таких регіонів очікувано виявилося найбільше (близько 2,4 відсотка). У середньому ж для всіх підвидів гени бонобо становлять близько 1 відсотка геному.
Дослідження показує, що еволюція наших найближчих родичів - шимпанзе і бонобо - характеризувалася, як і еволюція людини, епізодами гібридизації і перенесення генів. Так, люди сучасного типу після розселення з Африки отримали генетичний внесок як мінімум від двох інших груп давніх людей: неандертальців і денисівської людини.